سازمان جهاد اسلامی با انجام عملیات سال های 1986 و 1987، در ایجاد انتفاضه نقش عمده ای ایفا کرد. این امر، با خرسندی و هم سویی نیروهای دیگر و عموم مردم مسلمان فلسطین مواجه شد؛ زیرا بر سیاست صبر و انتظار دیگران خط بطلان می کشید.
جهاد اسلامی با صدور بیانیه ها و چاپ نشریات متعدد(1)مردم فلسطین را به شرکت در انتفاضه و انجام اعتصاب دعوت می کرد.
سازمان اخوان، عملاً دو ماه پس از آغاز انتفاضه در آن شرکت جست، در اینجا، آنچه شایان توجه می باشد، تحولی است که در استراتژی آن پدید آمد.
در استراتژی اخوان، طی مرحله پیشین، فراخوان برقراری جامعه اسلامی، حتی بدون توجه به مسئله آزادسازی فلسطین، در تقدم قرار داشت.
اما منشور- مرامنامه- جنبش مقاومت اسلامی که در خلال انتفاضه به نام « حماس» خوانده شده است، بر دگرگونی مهم در این استراتژی تأکید دارد، بویژه در آنچه به مسئله جهاد علیه اشغال مربوط می شود(به ماده 12 و 13 مرامنامه حماس رجوع شود.
ترجمه کامل مرامنامه حماس در کتاب دوم ما، انتفاضه: حماس و جهاد اسلامی آمده است).
شایان ذکر است که هم سویی عموم مردم با نیروهای اسلامی و انتفاضه، به انزوای دیگران بیش از پیش دامن می زد؛
بویژه سازمان سنتی اخوان که مدتهای طولانی از صحنه مبارزات رهایی بخش به دور مانده بود. این امر، به بروز جدال و بحث در رهبری اخوان انجامید.
بویژه که بسیاری از عناصر مذهبی به فعالیتهای انتفاضه پیوسته و به صورت نیروی محرکه آن درآمدند.
این امر، عملاً علت اصلی اعلام تشکیل جنبش حماس و آغاز اعلام تحرک و اقدام علیه اشغال بود.