سریعترین ابر رایانهی جهان برای کشف دارو یا درمان کروناویروس یا Covid-19 شروع به کار میکند تا هرچه سریعتر در مقابل این ویروس مرگبار ایستاد! همراه زومیت بمانید.
وزارت انرژی ایالات متحدهی آمریکا (US Department of Energy) اعلام کرده است که از ابر رایانهی سامیت (به انگلیسی: Summit) در تلاش برای یافتن درمان یا روشدرمانی Covid-19، که با نام coronavirus نیز شناخته میشود، استفاده خواهد شد. سامیت ابررایانهای ۱۰ مگاواتی است که با ۴۶۰۸ گره پردازش ساخته شده است. هر گره شامل پردازندههای دوتایی Power9 با سرعت ۳/۰۷ گیگاهرتز و شش پردازندهی گرافیکی Nvidia Volta V100 است. این سریعترین ابر رایانه روی زمین است؛ سامیت میتواند معادل ۱۴۸/۶ پتافلاپس در Linpack (یککتابخانهی نرمافزاری که به موازات (High Performance Linpack) برای معیار و رتبه بندی ابر رایانهها جهت لیست TOP500 استفاده میشود) و حداکثر عملکرد بیش از ۲۰۰ پتافلاپس عملکرد ارائه دهد.
دلیل اینکه DoE از سریعترین ابررایانهی جهان برای این پروژه بهره میبرد این است که تلاش برای یافتن روشهای مهار یا حملهی ویروس چالشی محاسباتی است. IBM میگوید:
هنگام تلاش برای درک ترکیبات جدید بیولوژیکی، مانند ویروس ها، محققان در آزمایشگاههای مرطوب میکروارگانیسم را رشد داده و می بینند که چگونه در شرایط واقعی نسبت به ترکیبات جدید واکنش نشان میدهند. اما این روند بدون رایانه و تجهیزات کامیپوتری میتواند آهسته باشد. از طرفی با استفاده از رایانه شبیهسازیهای دیجیتال انجام میشود تا محدودهی متغیرهای احتمالی را محدود کند؛ اما حتی پس از آن بازهم چالشهایی وجود دارد. شبیهسازیهای رایانهای میتوانند بررسی کنند که چگونه متغیرهای مختلف با ویروسهای مختلف واکنش نشانمیدهند. ولی هنگامی که هر یک از این متغیرها بهصورت جداگانه بتوانند از میلیونها یا حتی از میلیاردها قطعه از دادههای منحصربهفرد تشکیل شده و نیاز باشد آنها باهم ترکیب شوند، با استفاده از سختافزاری خاص این فرایند بسیار سریع انجام میگیرد.
فیلم کوتاه زیر چکیده کارهایی که دانشمندان با استفاده از سامیت انجام دادهاند، نشان میدهد. محققان ۸۰۰۰ ترکیب را در طی چند روز غربالگری کردند و ۷۷ ترکیب مولکولی کوچک، مفید و بالقوه را ساختند. در این ترکیبها شواهدی از مهار Covid-19 مشاهده شده است.